Wird die polyalphabetische Substitution beim Klartextzeichenvorrat Z2 = {0, 1} der Binärziffern verwendet, so gibt es nur zwei unterschiedliche permutierte Alphabete: (0 1) und (1 0).

Für jedes Bit des Klartextes gibt ein Bit des Schlüssels an, welche der beiden Permutationen angewendet werden soll. Anders ausgedrückt bestimmt das Bit des Schlüssels, ob das Bit des Klartexts unverändert oder negiert in den Chiffretext eingeht. Das bedeutet, dass sich der Chiffretext als Anwendung des exklusiven Oders (XOR) auf Klartext und Schlüssel ergibt.

Dieses Verfahren heisst Vernam-Chiffre.